Музей Героя Советского Союза, академика, писателя, общественного деятеля Малика Габдуллина был открыт согласно постановлению Кабинета Министров Республики Казахстан от 07.05.1993 г. за № 465 и распоряжения акима Кокшетауской области за № 1-391 р. от 4 сентября 1995 г. к 80-летию Героя.

В 2004 году здание музея, которому исполнилось 116 лет, было признано непригодным для дальнейшей эксплуатации. Акиматом Акмолинской области было принято решение о реконструкции.

19 августа 2005 года состоялось торжественное открытие нового здания музея. Первым посетителем музея был Президент РК Н.А. Назарбаев, который в это время находился с рабочим визитом в Акмолинской области. Глава государства отдал дань памяти М.Габдуллина и возложил корзину цветов к бюсту Героя.

Главная цель работы музея — посредством личности Героя Советского Союза, академика, писателя М.Габдуллина формирование в подрастающем поколении ответственности за защиту Родины, пропаганда героических традиций наших предков, усиление работы в этнопедагогическом направлении, воспитание нового казахстанского патриотизма.